Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms