Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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TCIRG1Q13488 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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TCIRG1Q13488 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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