Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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