Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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