Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms