Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME3Q13232 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NME3Q13232 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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