Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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