Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXC1Q12948 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXC1Q12948 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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FOXC1Q12948 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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