Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms