Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms