Protein–RNA interactions for Protein: Q12893

TMEM115, Transmembrane protein 115, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM115Q12893 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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TMEM115Q12893 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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TMEM115Q12893 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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TMEM115Q12893 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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TMEM115Q12893 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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TMEM115Q12893 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM115Q12893 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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