Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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