Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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