Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAPQ12770 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCAPQ12770 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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