Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms