Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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