Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms