Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms