Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms