Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms