Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms