Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms