Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL1Q00532 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms