Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms