Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL7P80098 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL7P80098 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL7P80098 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms