Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD2P62316 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD2P62316 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms