Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms