Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms