Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms