Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRG3P56975 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG3P56975 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms