Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SUMO3P55854 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SUMO3P55854 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SUMO3P55854 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SUMO3P55854 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SUMO3P55854 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SUMO3P55854 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO3P55854 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO3P55854 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms