Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms