Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF135P52742 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF135P52742 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms