Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGDP52209 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGDP52209 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGDP52209 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGDP52209 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGDP52209 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGDP52209 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGDP52209 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGDP52209 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGDP52209 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGDP52209 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGDP52209 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGDP52209 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms