Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms