Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms