Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR1BP42025 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms