Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL1P40616 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms