Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms