Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms