Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms