Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms