Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms