Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms