Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms