Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA3P25788 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms