Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRGP23470 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
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