Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD247P20963 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD247P20963 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms