Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSP16219 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSP16219 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSP16219 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSP16219 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSP16219 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSP16219 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSP16219 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSP16219 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSP16219 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSP16219 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSP16219 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACADSP16219 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSP16219 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms