Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms